2.1 财务管理工作难度增加
新会计制度出台后，事业单位的财务管理工作需要遵循“平行记账”原则，在此种状态下，新的财务管理工作相较于传统财务处理方式内容更多，操作也更为困难，其中主要体现在新制度下事业单位财务管理核算工作需要将预算、核算内容根据权责发生制来进行处理。从另一方面来看，部分事业单位的财务管理部门缺乏专业能力、综合能力较强的会计人员，从而导致在实际的财务管理工作当中难以满足新会计制度的要求，进而影响事业单位财务管理工作的顺利开展。2.2 会计核算难度增加
新会计制度要求事业单位在进行核算的过程中要遵循“平行记账”要求，而目前事业单位会计核算依旧以财务报表为主，并不能将核算内容和预算内容以及财务会计管理部分结合在一起，进而导致数据处理较为困难。目前，我国大多数事业单位的信息资源管理系统属于独立操作系统，与其他资源数据并没有建立共享通道，从而严重影响新会计制度的执行。除此之外，新会计制度对事业单位的财务管理报告有了新的要求，但由于很多事业单位的会计信息核算系统并不健全，自动化信息技术的缺失导致部分数据信息的处理需要人工进行操作，这无疑增大了工作人员的劳动强度和工作难度，而且不利于工作人员效率的提升。与此同时，人工输入可能会出现错误的情况，进而会对后续的财务工作产生不利影响[8]。2.3 财务管理工作报告难度提高
新会计制度实施下，事业单位被提出“双报告”要求，其中包含财务报告和预算报告。一般事业单位财务管理部门人员较少，及时给出两种报告对于事业单位较为困难。除此之外，在新冠肺炎疫情的影响下，国际经济市场局势较为动荡，在此种环境下我国事业单位需要加强对市场经济的宏观调控，这便使事业单位有较大数目的资金支出和回收，进而使财务报表内容增多，这也是财务管理工作报告难度增加的主要因素之一。2.4 资产核算难度增加
在事业单位的运营过程中，传统的财务管理工作对资产核算部门并没有足够的重视，这样导致了资产核算量较小。在新会计制度的要求下，事业单位需要加强对资产核算的重视程度，严格按照权责发生制来进行相关资产核算，从而导致事业单位的资产管理问题逐步显露出来，例如资产未及时入账、资产缺失、资产管理意识不够等，这也极大地增加了资产核算的难度。
